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据金山区介绍，金山铁路从上海南站出发，在金山卫站结束，是上海第一条面向高密度、短间隔公共交通，实行政府购买服务的市政铁路。然而，到目前为止，它还没有达到公共交通的标准，其直达列车在高峰时段几乎满员，因此列车密度已不能满足交通需求。
上海CPPCC联络指导小组副组长、金山CPPCC董事长、市委书记王梅新向CPPCC十三届二次会议提交议案，建议尽快实施莘庄至上海南站的三、四号线工程，使金山铁路完全具备自主运营条件，满足金山区未来的出行需求。
在这份题为《关于加快三、四号线建设、提高金山铁路公共交通运营能力的建议》的提案中，王梅新指出，自2012年9月开通以来，金山铁路日均列车数已从15对逐步增加到36对。目前，它有三种运行模式:一站直达、大站和站站。
其中，有15对直达列车，全程运行时间为32分钟；两对火车停在大车站，整个运行时间为42分钟；有19对列车停在车站，整个运行时间为60分钟；同时采用“工作日”和“非工作日”两套操作图。
据统计，2012年10月至2017年6月，金山铁路共发送旅客3788万人次，日均客流从开通之初的1.3万人次增加到2017年5月的3万人次。在客流中，直达客流分别占上海南站和金山卫站的46.2%和35.2%。
其中，早晚客流高峰明显。以晨峰为例。目前，从上海南站到金山卫有5趟列车从6: 00到8: 00运行，从金山卫到上海南站有7趟列车从6: 00到8: 00运行。虽然连续有3对直达列车，但仍不能满足运输需求。
这也带来了一个问题。由于直达列车和停在大站的列车的运行，停在站的列车之间的平均运行间隔为48分钟，最大运行间隔为71分钟。中间站列车密度低，乘客等待时间长，对客流的吸引力小。
王梅新认为，由于金山铁路运行的列车与上海南站至莘庄的沪杭线在同一条线上，列车运行计划受到三个方面的限制:
1.上海南站至莘庄的通行能力很紧张。
2.上海南站的抵离能力比较紧张，金山铁路列车的抵离路线只有两条。
3.受沪杭普通高速列车运行时间的限制。目前，上海南站至新庄段共有111对列车，其中客车96对，其他列车15对。该路段通过能力和上海南站到发能力相对紧张；同时，根据上海铁路枢纽的调整，沪苏湖高速铁路、沪杭高速铁路和沪杭城际铁路将全部引入上海南站，而莘庄至上海南站为双线，因此增加金山铁路的列车数量将更加困难。
王梅新在方案中透露，出现这种情况的原因在于，在金山铁路的设计阶段，新庄至上海南站作为一个独立项目，拟由沪杭公司实施(项目投资约7.47亿元)，但由于种种原因未能实施，导致新庄至上海南站段成为制约金山铁路完全独立运营的瓶颈。只有尽快实施三、四号线工程，才能突破瓶颈，使金山铁路"自由"和"跑得更开心"。
